利用转录组测序技术为动植物基因组构建精确完善的基因注释，包括编码基因、非编码基因、选择性剪接、基因融合，挖掘新基因功能，探索非编码RNA对基因表达调控的影响。
通过整合多组学数据，包括基因组、转录组、甲基化组、翻译组数据，建立多组学数据之间关联性，构建生物信息学数据库，开发组学数据处理流程及分析软件。
利用核糖体印迹测序技术从基因组水平了解蛋白质的翻译情况、翻译速率及表达丰度，从非编码RNA中鉴定可翻译的开放阅读框，并研究其编码的微蛋白的生物学功能。
利用高通量测序技术和多组学分析方法，筛选疾病相关靶点蛋白，使用虚拟筛选技术将靶点蛋白与大量小分子库进行分子对接，分析小分子与靶点蛋白之间的相互作用，筛选药物候选先导化合物。