分子对接技术是一种重要的计算机辅助药物设计方法，通过计算模拟受体与配体之间相互作用预测结合构象进行药物虚拟筛选，广泛应用于药物发现和药物再利用。AutoDock4和AutoDock Vina是目前最流行的分子对接工具，其引用分别为1.6万+和2万+。AutoDock4和AutoDock Vina都是命令行工具，没有操作界面，不易于使用。虽然AutoDock4有对应的界面工具MGLTools，但MGLTools无法进行批量分子对接。因此，我们团队基于AutoDock开发了一款名为Dockey的批量分子自动对接软件。
Dockey使用Python语言编写，具有友好的操作界面，能跨平台运行于Windows、Linux、MacOS系统上。Dockey支持使用AutoDock4、AutoDock Vina、QuickVina-W作为对接引擎，同时整合了OpenBabel、PyMOL、AutoDockTools、Meeko、RDKit、PLIP等工具，实现了分子对接的完整流程，包括分子数据清洗、受体与配体准备、批量对接、受体-配体相互作用分析、对接构象3D结构可视化等，为药物虚拟筛选提供简便、快捷、易操作的工具。Dockey能将数以万计的小分子自动对接到多个受体上，所有数据保存在一个后缀名为.dock的文件中，可在不同系统和不同电脑之间重复利用。