Dockey使用Python语言编写，具有友好的操作界面，能跨平台运行于Windows、Linux、MacOS系统上。Dockey支持使用AutoDock4、AutoDock Vina、QuickVina-W作为对接引擎，同时整合了OpenBabel、PyMOL、AutoDockTools、Meeko、RDKit、PLIP等工具，实现了分子对接的完整流程，包括分子数据清洗、受体与配体准备、批量对接、受体-配体相互作用分析、对接构象3D结构可视化等，为药物虚拟筛选提供简便、快捷、易操作的工具。Dockey能将数以万计的小分子自动对接到多个受体上，所有数据保存在一个后缀名为.dock的文件中，可在不同系统和不同电脑之间重复利用。

Pyfastx是一个轻量级的Python C扩展模块，方便用户在Python环境下解析FASTA/Q文件。Pyfastx通过构建索引使其能从FASTA/Q文件中随机截取序列。Pyfastx的一大特色功能是能直接从Gzip压缩的FASTA/Q文件中读取指定序列或片段，pyfastx在所有支持随机读取的工具中，内存消耗最少，速度比其它Python包快。Pyfastx具有更大的兼容性，甚至能解析非标准FASTA文件，Pyfastx还带有命令行工具，帮助用户抓取序列、分割序列文件、随机抽取序列等。

PSMD (Pan-Species Microsatellite Database, 全物种微卫星数据库), PSMD包含从18,000多个物种基因组中鉴定的678,106,741个完美型微卫星和43,848,943个复合型微卫星，几乎涵盖了所有有基因组数据的物种。 除交互式浏览界面外，PSMD还为用户提供了灵活的过滤功能，可从大数据集中快速获取所需的微卫星位点。PSMD允许用户导出GFF3格式的文件和CSV格式的统计文件以进行下游分析。 PSMD还提供一个在线工具，根据用户自定义的参数，搜索微卫星位点。 此外，PSMD还嵌入了Primer3软件，以帮助用户设计高质量的引物。

MACSNVdb (Macaca SNV database)，猕猴SNV变异数据库方便研究人员研究不同猕猴种间遗传差异。MACSNVdb目前包含74,506,801个来源于20个猕猴基因组的高质量非冗余SNV位点。MACSNVdb允许用户浏览和获取个体的、特有的和非冗余的SNV位点。用户可以检索与人类疾病和药物靶基因同源基因上的非同义SNV位点。MACSNVdb还整合了基因功能注释信息，包括GO功能、KEGG通路、Pfam、InterPro。

Krait是一个功能强大、灵活的微卫星搜索软件，Krait能从全基因组DNA序列中搜索完美型、非完美型和复合型微卫星。Krait提供友好的用户界面，易于操作，且运行速度快。Krait还整合了Primer3软件，帮助用户直接为微卫星标记设计引物。些外，Krait还能进行统计分析，能将微卫星导出为FASTA和GFF3格式进行下游分析。