关于我们
随着高通量测序技术的飞速发展，雪崩式的基因组学大数据正向我们奔袭而来，如何从这些海量数据中挖掘生物学知识，已成为生物信息学亟需解决的核心问题。课题组以高通量测序数据为基础，运用生物信息学和分子生物学技术，解密基因信息，识别基因组暗物质，并探索基因表达调控机制。
随着高通量测序技术的飞速发展，雪崩式的基因组学大数据正向我们奔袭而来，如何从这些海量数据中挖掘生物学知识，已成为生物信息学亟需解决的核心问题。课题组以高通量测序数据为基础，运用生物信息学和分子生物学技术，解密基因信息，识别基因组暗物质，并探索基因表达调控机制。
课题组利用二代和三代高通量测序技术，组装完整的动植物基因组，注释完整基因信息，绘制基因表达谱；识别基因组中非编码RNA，可翻译的非编码RNA，并探索这些基因组暗物质对基因表达调控的机理；整合多组学测序数据，构建生物信息学数据库，开发高通量测序数据处理流程及分析软件。
课题组使用二代和三代测序技术结合多组学分析技术解密基因组信息
从头拼接组装基因组，识别基因变异位点，全基因组关联分析
绘制基因表达谱，鉴定差异表达基因和选择性剪接事件
评估全基因组甲基化水平，鉴定差异甲基化区域
了解蛋白质表达情况及丰度，识别可翻译的非编码RNA
Qingqing Zhang† , Cheng Chen† , Xiaoqin Mu, Zihan Zhang, Cuiling Luo, Chenjuan Zeng, Bisong Yue, Zhenxin Fan*, Lianming Du*. Alleviation of Ulcerative Colitis in Mice by Individual Fermentation of Periplaneta americana Powder with L. bulgaricus SN22 and S. thermophilus SN05. Microorganisms, 2026, 14(2):301.
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Lianming Du, Jiahao Chen, Qin Liu, Songwen Tan, Peng Guo*. High-quality chromosome-level genome assembly of the snake Pseudoxenodon stejnegeri (Squamata: Colubridae). Scientific Data, 2026, 13:93.
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Lianming Du*, Jiahao Chen, Dalin Sun, Kelei Zhao, Qianglin Zeng, Nan Yang*. Krait2: a versatile software for microsatellite investigation, visualization and marker development. BMC Genomics, 2025, 26:72.
