生物信息学与整合基因组学课题组
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Krait
Krait是一个功能强大、灵活的微卫星搜索软件,Krait能从全基因组DNA序列中搜索完美型、非完美型和复合型微卫星,同时能进行引物设计
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历史版本
最新版本
1.5.1
开发语言
Python, C
主页
https://github.com/lmdu/krait
文档
https://krait.biosv.com
Krait是一个功能强大、灵活的微卫星搜索软件,Krait能从全基因组DNA序列中搜索完美型、非完美型和复合型微卫星。Krait提供友好的用户界面,易于操作,且运行速度快。Krait还整合了Primer3软件,帮助用户直接为微卫星标记设计引物。些外,Krait还能进行统计分析,能将微卫星导出为FASTA和GFF3格式进行下游分析。
Citation:
Lianming Du, Chi Zhang, Qin Liu, Xiuyue Zhang, Bisong Yue.
Krait: an ultrafast tool for genome-wide survey of microsatellites and primer design
.
Bioinformatics
, 2018, 34(4):681–683.
Windows, 64bit
MacOS, 64bit
Linux, 64bit
Ubuntu, 64bit
1.5.1
2023-09-08
Fixed statisitcal exporting error
Fixed mapping error
Fixed statistics error when no repeat sequence found
Krait-v1.5.1-linux.tar.gz
Krait-v1.5.1-amd64.deb
Krait-v1.5.1-macos.dmg
Krait-v1.5.1-win64.exe